43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0677 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0677  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1000  pentapeptide repeat-containing protein  56.76 
 
 
118 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000366371  unclonable  5.80978e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0975  pentapeptide repeat domain protein  55.86 
 
 
114 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000613608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0840  pentapeptide repeat-containing protein  55.56 
 
 
114 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000049264  decreased coverage  0.0000626764 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_4794  pentapeptide repeat-containing protein  57.55 
 
 
114 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103308  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62240  hypothetical protein  55.36 
 
 
115 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000219088  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5418  hypothetical protein  56.48 
 
 
115 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0625399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3061  pentapeptide repeat-containing protein  54.9 
 
 
121 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 
14916 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4165  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
456 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 
256 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 
900 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4125  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
456 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
973 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 
263 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  36.51 
 
 
563 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  36.51 
 
 
563 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  32.26 
 
 
259 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.37 
 
 
381 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.47 
 
 
600 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
489 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
524 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 
267 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  41.51 
 
 
846 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  27.47 
 
 
264 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 
340 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 
213 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  33.93 
 
 
325 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  27.47 
 
 
266 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 
447 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 
412 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
299 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  33.87 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 
319 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  38.78 
 
 
844 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>