More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0679 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  71.28 
 
 		 206 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 166 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  65.13 
 
 		 167 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  63.51 
 
 		 166 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 166 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 166 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 166 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  62.67 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 165 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 165 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 167 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  57.42 
 
 		 164 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 172 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 167 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  57.5 
 
 		 168 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  56.67 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  58 
 
 		 168 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  56.76 
 
 		 165 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  54.67 
 
 		 169 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 166 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 166 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 163 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 166 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 175 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 169 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  56.46 
 
 		 176 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  51.32 
 
 		 163 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  56.16 
 
 		 147 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 174 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 147 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  57.53 
 
 		 147 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 158 aa  169  4e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  62.16 
 
 		 168 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  56.43 
 
 		 182 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 168 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 163 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  55.7 
 
 		 173 aa  168  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 163 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 147 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  54.05 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 162 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 189 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  57.45 
 
 		 146 aa  165  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 189 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  56.43 
 
 		 162 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 162 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 168 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 183 aa  165  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 172 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 163 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 147 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  47.9 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 147 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 147 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 163 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 165 aa  162  4.0000000000000004e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  48.48 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 169 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 169 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  51.35 
 
 		 165 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  49.4 
 
 		 179 aa  161  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  54.05 
 
 		 162 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  54.05 
 
 		 162 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  61.03 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 180 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 172 aa  161  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 169 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  56.03 
 
 		 146 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 168 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 172 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  49.32 
 
 		 162 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 180 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  51.22 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  49.32 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  51.74 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 169 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 162 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 172 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  60.29 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  59.56 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 172 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  49.12 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  58.99 
 
 		 172 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>