More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0035 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl036  methionyl-tRNA synthetase  70.08 
 
 		 509 aa  753    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0035  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1039    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 645 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 650 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 648 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 681 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 667 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 653 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 675 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 655 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 653 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 660 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 660 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 660 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 651 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 632 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 654 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 666 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 675 aa  442  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 665 aa  438  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 702 aa  438  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 659 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 657 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 656 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 657 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0187  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 521 aa  430  1e-119  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 650 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 654 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 664 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 651 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 648 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 645 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 650 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 671 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 629 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 629 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 645 aa  391  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf217  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000797425  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 642 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 647 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 634 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 632 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 634 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 536 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 628 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 644 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 636 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 663 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 533 aa  364  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 640 aa  364  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 629 aa  362  6e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 628 aa  361  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 657 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 624 aa  360  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 638 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  37.23 
 
 		 574 aa  355  7.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5259  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 628 aa  355  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 642 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 628 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 530 aa  353  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 550 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 523 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 539 aa  348  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 648 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 538 aa  347  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 519 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 531 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>