More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0187 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0187  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
521 aa  1078    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
648 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
650 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
666 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
660 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
659 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
660 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
660 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
660 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
660 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
660 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
660 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 
660 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
667 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
657 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
656 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
660 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
665 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl036  methionyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
509 aa  457  1e-127  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
675 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
660 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
657 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
651 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
702 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
681 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
650 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
632 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
518 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
655 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
645 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
675 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
645 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0035  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
509 aa  430  1e-119  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
645 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
653 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
654 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
512 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
653 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
516 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
645 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
650 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
651 aa  412  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
533 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
647 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
647 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
506 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
634 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
629 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
629 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
511 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
509 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
664 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
508 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
522 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
671 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
638 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
510 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
509 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf217  methionyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
517 aa  385  1e-106  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000797425  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
624 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
634 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
509 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
628 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
509 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
648 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
516 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
523 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
654 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
511 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
516 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  39.08 
 
 
574 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 
535 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
519 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 
535 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
632 aa  375  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
515 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
515 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
515 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
514 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
515 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
544 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
519 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
659 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
516 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
638 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
516 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
550 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
515 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
514 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
530 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
722 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
525 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
515 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
515 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
519 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
511 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
530 aa  363  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
538 aa  362  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
531 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
526 aa  361  2e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>