More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2875 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  41.97 
 
 		 936 aa  727    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  47.26 
 
 		 1035 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 958 aa  1866    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  50.97 
 
 		 958 aa  797    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 		 942 aa  902    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 		 947 aa  855    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  43.12 
 
 		 852 aa  687    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  78.8 
 
 		 949 aa  1376    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  44.62 
 
 		 962 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  38.49 
 
 		 4317 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.23 
 
 		 4317 aa  334  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  39.05 
 
 		 4317 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 		 586 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  39.9 
 
 		 4318 aa  330  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  39.4 
 
 		 4317 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 1474 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 592 aa  321  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.4 
 
 		 4336 aa  320  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  37.48 
 
 		 4332 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.36 
 
 		 2791 aa  319  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 1272 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  39.59 
 
 		 3235 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.27 
 
 		 1789 aa  313  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  36.72 
 
 		 2820 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.49 
 
 		 6889 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 586 aa  311  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 586 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.88 
 
 		 546 aa  310  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.61 
 
 		 1801 aa  310  9e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.73 
 
 		 4336 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 586 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.29 
 
 		 4342 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 577 aa  307  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  35.9 
 
 		 2997 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 		 2250 aa  306  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 		 3231 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.46 
 
 		 4342 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 1292 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 603 aa  301  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 586 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 609 aa  299  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  35.92 
 
 		 1067 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  38.45 
 
 		 1776 aa  296  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 584 aa  294  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 576 aa  293  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  36.88 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  36.98 
 
 		 576 aa  291  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  36.88 
 
 		 576 aa  291  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 1656 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  37.92 
 
 		 1779 aa  290  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 578 aa  290  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  37.79 
 
 		 1283 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  37.79 
 
 		 1291 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  37.1 
 
 		 563 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  37.79 
 
 		 1276 aa  290  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 614 aa  290  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 653 aa  290  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 1323 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  36.79 
 
 		 573 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 648 aa  288  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 595 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.62 
 
 		 581 aa  285  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.77 
 
 		 6403 aa  284  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 560 aa  283  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 725 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.5 
 
 		 3208 aa  283  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.83 
 
 		 544 aa  283  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 725 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  35.11 
 
 		 608 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 		 544 aa  281  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.03 
 
 		 581 aa  280  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  35.79 
 
 		 619 aa  278  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.88 
 
 		 1753 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 		 544 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 		 544 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 		 2762 aa  278  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  32.09 
 
 		 588 aa  278  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  37.54 
 
 		 2721 aa  277  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  33.85 
 
 		 738 aa  275  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  37.03 
 
 		 601 aa  274  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  33.95 
 
 		 576 aa  274  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 606 aa  274  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.83 
 
 		 544 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.9 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 573 aa  271  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 839 aa  271  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 		 544 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 		 544 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 597 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 		 629 aa  271  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 574 aa  271  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 701 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 585 aa  269  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 597 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 593 aa  268  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 629 aa  267  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 602 aa  267  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 629 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>