236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1882 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  62.44 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.55 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.87 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.6 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  31.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  31.48 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  32.72 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.14 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.96 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.96 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  31.88 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  31.05 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  30.32 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  30.26 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  30.88 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  29.73 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.49 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  29.52 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.31 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  28.71 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  30.91 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.86 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.38 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.61 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  27.01 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.574819  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  25.12 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  25.59 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  32.37 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  27.41 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  27.4 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  26.48 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.82 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.38 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  26.92 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  25.59 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  23.93 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  29.2 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.55 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  26.55 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  26.55 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 477 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  29.28 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.2 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 477 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  27.11 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 477 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 477 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 326 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.01 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 477 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  27.42 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.17 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 301 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  26.99 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  26.87 
 
 		 512 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>