98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2448 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1437    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 713 aa  1437    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  40.37 
 
 		 657 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  40.54 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  40.54 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  40.43 
 
 		 657 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  41.19 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  41.13 
 
 		 680 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  40.09 
 
 		 656 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  40.85 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 		 657 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  32.78 
 
 		 672 aa  211  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  30.48 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  30.48 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  31.65 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  33.05 
 
 		 655 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 664 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 664 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  31.35 
 
 		 608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 664 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  31.35 
 
 		 608 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  31.34 
 
 		 664 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  32.14 
 
 		 614 aa  196  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 		 664 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  29.48 
 
 		 609 aa  195  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  33.41 
 
 		 611 aa  195  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.86 
 
 		 781 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  30.96 
 
 		 672 aa  190  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  33.55 
 
 		 615 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 627 aa  187  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 		 612 aa  186  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  32.61 
 
 		 615 aa  184  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  31 
 
 		 677 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  33.06 
 
 		 654 aa  181  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  30.79 
 
 		 682 aa  180  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  29.67 
 
 		 608 aa  180  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  29.98 
 
 		 685 aa  180  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  31.64 
 
 		 608 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  31.35 
 
 		 608 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  30.51 
 
 		 608 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  31.77 
 
 		 655 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  31.57 
 
 		 608 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  31.74 
 
 		 681 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  31.57 
 
 		 608 aa  177  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  31.82 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  30.26 
 
 		 657 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  32.6 
 
 		 612 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  30.95 
 
 		 668 aa  173  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  29.75 
 
 		 678 aa  173  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  29.68 
 
 		 614 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  28.69 
 
 		 674 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  31.04 
 
 		 683 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 614 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  29.98 
 
 		 608 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  31.81 
 
 		 672 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  30.57 
 
 		 674 aa  167  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  30.53 
 
 		 667 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  29.84 
 
 		 627 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  28.83 
 
 		 731 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 750 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  31.73 
 
 		 614 aa  163  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  29.94 
 
 		 696 aa  163  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  30.14 
 
 		 677 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  28.54 
 
 		 629 aa  161  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  28.75 
 
 		 629 aa  160  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  31.15 
 
 		 691 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 		 615 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  30.1 
 
 		 678 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  27.26 
 
 		 693 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.27 
 
 		 774 aa  153  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.86 
 
 		 815 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  29.86 
 
 		 704 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.41 
 
 		 619 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  30.87 
 
 		 611 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  30.58 
 
 		 667 aa  144  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  28.91 
 
 		 647 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  30.4 
 
 		 622 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  31.2 
 
 		 365 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  28.57 
 
 		 636 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.2 
 
 		 777 aa  134  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 653 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  32.65 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  29.98 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  29.76 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  25.74 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  25.74 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  25.74 
 
 		 448 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  33.33 
 
 		 272 aa  51.6  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  23.04 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  20.73 
 
 		 755 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  24.28 
 
 		 636 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  22.98 
 
 		 619 aa  45.8  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  24.33 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  45.9 
 
 		 101 aa  44.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>