109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4092 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  100 
 
 		 345 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  43.07 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  40.74 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  39.43 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  37.78 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  38.57 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  37.97 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  35.53 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.47 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  32.85 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.03 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  33.74 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.87 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  28.99 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  30.14 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  31.04 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  35.98 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  30.68 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  29.91 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  32.93 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  32.93 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  47.13 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  32.62 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  51.18 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  51.18 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  51.18 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  51.18 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  51.18 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  51.18 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  46.5 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  27.03 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  32.22 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  30.27 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  29.82 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  32.32 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  30.68 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  30.68 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  27.3 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  30.68 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  33.14 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  33.14 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  33.14 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  33.14 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  47.24 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  27.13 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  27.13 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  32.26 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  32.84 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  28.93 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  28.86 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  29.79 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  26.84 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  34.25 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  25.23 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  28.15 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  26.11 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  26.59 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  24.86 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  24.86 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  27.25 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.34 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.85 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  25.41 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  25.41 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  25.41 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  25.41 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  25.41 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  27.22 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  24.46 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.93 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  24.73 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.73 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  21.36 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  25.92 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  24.7 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.25 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  24.7 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  24.7 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  21.36 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  21.36 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  24.39 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  24.39 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  24.39 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  24.39 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  29.14 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  23.2 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  23.2 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.2 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.5 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  36.28 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.58 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  25.47 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  26.65 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  24.31 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  28.95 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.46 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  23.36 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  35.38 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  31.73 
 
 		 534 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  35.64 
 
 		 528 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>