More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0459 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  70.95 
 
 		 185 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  72.78 
 
 		 186 aa  245  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  70.65 
 
 		 188 aa  244  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  65.71 
 
 		 197 aa  221  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  70.66 
 
 		 172 aa  210  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  68.54 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  51.35 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  54.65 
 
 		 178 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  51.35 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  51.35 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  50 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  51.72 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.45 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  50.27 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  49.73 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  50.86 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  50.29 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  50.29 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  50.54 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  52.33 
 
 		 174 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  43.26 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  45.93 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  49.71 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  46.82 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  50 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  49.71 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  49.7 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  41.15 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  39.9 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.72 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  40.72 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  43.75 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  39.13 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  41.14 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  39.13 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  38.59 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  43.01 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.88 
 
 		 203 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  41.53 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  44.81 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  38.22 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  38.89 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  41.99 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.11 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  42.54 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.64 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  37.57 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  44.44 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  39.56 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  39.08 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  39.2 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  39.08 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  38.51 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  40.91 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  39.11 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  34.73 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  34.52 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  38.73 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  38.73 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  39.43 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  35.03 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  38.73 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.87 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35.16 
 
 		 176 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  38.15 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  38.15 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.88 
 
 		 441 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  38.92 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.27 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  43.33 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  35.16 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  36.41 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  35.16 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.84 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.41 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.41 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  35.03 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.07 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  36 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  35.03 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.42 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  36.76 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36.76 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  35.71 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  39.2 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  34.62 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  35.87 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  31.52 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  35.39 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>