More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0803 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 
296 aa  603  1e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  66.44 
 
 
308 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  49.34 
 
 
303 aa  293  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.99126e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  47.96 
 
 
293 aa  286  3e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  47.06 
 
 
308 aa  272  4e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  5.57387e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.12 
 
 
297 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.95362e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  39.93 
 
 
322 aa  220  2e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  41.7 
 
 
320 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  41.31 
 
 
393 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  41.47 
 
 
320 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  41.47 
 
 
312 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  41.47 
 
 
320 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  41.47 
 
 
320 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  38.93 
 
 
330 aa  216  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  41.47 
 
 
291 aa  216  3e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  39.64 
 
 
309 aa  214  1e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  39.46 
 
 
333 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  36.82 
 
 
313 aa  200  2e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 
303 aa  199  4e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 
303 aa  199  4e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 
303 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  37.4 
 
 
304 aa  197  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  37.8 
 
 
304 aa  198  1e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  37.07 
 
 
304 aa  197  2e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  35.23 
 
 
294 aa  190  3e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  35.23 
 
 
310 aa  190  3e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 
312 aa  179  6e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 
329 aa  174  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 
297 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  33.07 
 
 
398 aa  148  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  34.34 
 
 
324 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 
328 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.12872e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  30.84 
 
 
321 aa  145  8e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 
330 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 
306 aa  141  1e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 
312 aa  141  1e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 
309 aa  141  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 
317 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 
310 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 
296 aa  133  4e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  30.35 
 
 
307 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  28.74 
 
 
511 aa  130  2e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 
316 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 
339 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 
298 aa  117  2e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 
343 aa  113  4e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  28 
 
 
298 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
298 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
298 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  26.19 
 
 
350 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.16 
 
 
301 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  22.99 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  26.01 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.44 
 
 
293 aa  85.5  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
292 aa  85.1  1e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  24.66 
 
 
316 aa  85.1  1e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 
312 aa  83.6  3e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 
316 aa  83.6  4e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  22.71 
 
 
304 aa  82.8  7e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 
303 aa  81.6  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
304 aa  81.6  1e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.32 
 
 
305 aa  81.6  1e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.27 
 
 
296 aa  82  1e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 
287 aa  82  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.21353e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 
304 aa  80.9  2e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 
292 aa  81.3  2e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 
317 aa  80.9  3e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
299 aa  79.7  6e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  25.21 
 
 
337 aa  79.7  6e-14  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  24.5 
 
 
303 aa  79.7  6e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 
292 aa  79.3  7e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  21.52 
 
 
315 aa  79.3  7e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.01463e-07  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  24.2 
 
 
306 aa  79  9e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  22.94 
 
 
309 aa  79  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 
316 aa  78.2  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 
277 aa  77.4  2e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  26.05 
 
 
305 aa  77.8  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  18.85 
 
 
306 aa  77.8  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  23.19 
 
 
310 aa  77.8  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.47 
 
 
286 aa  77.8  2e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  6.51268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 
302 aa  77  3e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  23.53 
 
 
290 aa  76.6  4e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.36 
 
 
298 aa  76.3  5e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 
290 aa  76.3  5e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  24.78 
 
 
301 aa  76.6  5e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 
297 aa  76.3  6e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 
317 aa  76.3  6e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  22.35 
 
 
300 aa  75.9  7e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  25.56 
 
 
297 aa  76.3  7e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  23.59 
 
 
308 aa  75.1  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.03257e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 
311 aa  75.5  1e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  26.81 
 
 
308 aa  75.1  1e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.1133e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  23.69 
 
 
321 aa  75.1  1e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  22.33 
 
 
290 aa  75.1  1e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  27.63 
 
 
290 aa  75.5  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 
319 aa  75.1  1e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.37 
 
 
298 aa  75.5  1e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 
371 aa  74.7  2e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 
302 aa  74.3  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  26.49 
 
 
320 aa  73.9  3e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>