68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  100 
 
 
421 aa  794    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  40.91 
 
 
467 aa  242  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  40.11 
 
 
402 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.86 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  36.23 
 
 
469 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.22 
 
 
420 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  37.74 
 
 
444 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  35.57 
 
 
494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  35.07 
 
 
425 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  34.9 
 
 
426 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  35.71 
 
 
395 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.87 
 
 
408 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.02 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  35.47 
 
 
431 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  35.41 
 
 
430 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  35.03 
 
 
418 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  35.03 
 
 
418 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  35.97 
 
 
428 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  38.11 
 
 
408 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  35.19 
 
 
477 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.12 
 
 
427 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  32.67 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.49 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  35.71 
 
 
434 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  35.48 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  37.22 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  34.06 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  34.06 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  35.69 
 
 
477 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  36.57 
 
 
455 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  32.55 
 
 
417 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  34.06 
 
 
398 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  39.06 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  38.92 
 
 
378 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  33.33 
 
 
478 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  34.5 
 
 
422 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  34.5 
 
 
422 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  34.5 
 
 
422 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  34.34 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  34.34 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  34.34 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  37.25 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.34 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.74 
 
 
570 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  33.44 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  33.44 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  33.44 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  32.4 
 
 
420 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  31.84 
 
 
419 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  34.17 
 
 
455 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  35.23 
 
 
428 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  35.23 
 
 
428 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  35.23 
 
 
428 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  32.58 
 
 
437 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  34.67 
 
 
463 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  32.81 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  33.73 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  33.66 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0649  hypothetical protein  35.47 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.71 
 
 
734 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  23.76 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  29.2 
 
 
429 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  25.68 
 
 
734 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  27.48 
 
 
427 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  24.86 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  29.18 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  21.8 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.32718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>