206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2034 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
449 aa  887    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  43.83 
 
 
460 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.78 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  39 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.47 
 
 
469 aa  203  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1627  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.26 
 
 
523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2353  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.73 
 
 
430 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.76 
 
 
447 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.24 
 
 
452 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  27.73 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  28.6 
 
 
487 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.65 
 
 
458 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  29.55 
 
 
438 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.08 
 
 
438 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.88 
 
 
664 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  28.09 
 
 
458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  28.88 
 
 
452 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  27.15 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.57 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.27 
 
 
472 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.77 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.23 
 
 
475 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.06 
 
 
431 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.23 
 
 
468 aa  113  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.6 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.06 
 
 
451 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.66 
 
 
473 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.66 
 
 
470 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.97 
 
 
462 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.24 
 
 
477 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.77 
 
 
474 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.12 
 
 
448 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.12 
 
 
487 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  28 
 
 
452 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.91 
 
 
448 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  27.23 
 
 
445 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.61 
 
 
469 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  25.87 
 
 
478 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  28.04 
 
 
677 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  25 
 
 
445 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.18 
 
 
458 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  28.35 
 
 
441 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  28.35 
 
 
441 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 
454 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.39 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  26.07 
 
 
437 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  27.15 
 
 
541 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  24.89 
 
 
454 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  27.15 
 
 
541 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.5 
 
 
554 aa  94.4  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  27.19 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.73 
 
 
454 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.73 
 
 
454 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.48 
 
 
455 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.25 
 
 
478 aa  93.6  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  28.89 
 
 
441 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.53 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.35 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.16 
 
 
504 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  24.26 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.95 
 
 
457 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.15 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  26.14 
 
 
487 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.51 
 
 
457 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.4 
 
 
482 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  24.84 
 
 
471 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.47 
 
 
933 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.14 
 
 
543 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  25.6 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  25.28 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.68 
 
 
657 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.68 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.92 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  25.56 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  29.69 
 
 
665 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25.93 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.38 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.57 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.76 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.12 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.09 
 
 
479 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.05 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  26.46 
 
 
668 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.79 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.32 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.7 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  26.24 
 
 
575 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.54 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  26.28 
 
 
669 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  25.33 
 
 
632 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  25.5 
 
 
692 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.26 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.95 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  27.59 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1517  flagellar capping protein  25.61 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.94 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.81 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  24.02 
 
 
456 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.95 
 
 
852 aa  77  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>