More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0315 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
572 aa  1096    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  64.56 
 
 
592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.09 
 
 
565 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.81 
 
 
569 aa  525  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.85 
 
 
601 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  50.46 
 
 
576 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  51.38 
 
 
551 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.73 
 
 
544 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  47.27 
 
 
547 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
547 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
540 aa  336  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
532 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
564 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
606 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
663 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
565 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
634 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
515 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
510 aa  160  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
597 aa  156  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
509 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
550 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.13 
 
 
677 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  23.15 
 
 
564 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
563 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
547 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.58 
 
 
551 aa  108  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.21 
 
 
569 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
528 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.6 
 
 
561 aa  106  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.47 
 
 
279 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.56 
 
 
563 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.52 
 
 
543 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.22 
 
 
288 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.29 
 
 
278 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.29 
 
 
572 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  36.27 
 
 
279 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.62 
 
 
297 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
555 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.47 
 
 
278 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
288 aa  100  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.48 
 
 
288 aa  99.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  26.24 
 
 
543 aa  99.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3756  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.38 
 
 
277 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.18 
 
 
285 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.75 
 
 
263 aa  97.8  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.03 
 
 
282 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.3 
 
 
586 aa  96.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1544  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.66 
 
 
297 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 
560 aa  96.3  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
550 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
550 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25 
 
 
530 aa  96.3  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.67 
 
 
285 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
293 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.18 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.34 
 
 
284 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.73 
 
 
279 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
530 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30 
 
 
278 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.69 
 
 
308 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1097  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.67 
 
 
284 aa  94  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.02 
 
 
249 aa  94  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.17 
 
 
278 aa  93.6  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
551 aa  93.6  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
275 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  37.02 
 
 
269 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3173  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.18 
 
 
290 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 
551 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.35 
 
 
536 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  34.33 
 
 
283 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0793  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
279 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  26.57 
 
 
540 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.09 
 
 
282 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.42 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  30.04 
 
 
277 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  26.35 
 
 
536 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5478  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.3 
 
 
298 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168073  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  24.7 
 
 
509 aa  91.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0557  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
284 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.49996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0582  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35 
 
 
284 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.513137  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  24.86 
 
 
516 aa  91.3  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  26.14 
 
 
536 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0593  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35 
 
 
284 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.87 
 
 
291 aa  90.9  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.78 
 
 
275 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1798  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.27 
 
 
292 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0366388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.78 
 
 
275 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  34.7 
 
 
228 aa  90.9  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.33 
 
 
279 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  25.73 
 
 
536 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  25.73 
 
 
536 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.44 
 
 
277 aa  90.5  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.16 
 
 
275 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.03 
 
 
276 aa  90.5  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  25.58 
 
 
535 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  25.52 
 
 
536 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  25.52 
 
 
536 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4180  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.53 
 
 
277 aa  90.1  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456448  normal  0.122933 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3860  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  31.53 
 
 
277 aa  90.1  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>