More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4064 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  100 
 
 
226 aa  453  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  48.66 
 
 
221 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  48.88 
 
 
221 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  44.05 
 
 
226 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  46.61 
 
 
221 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  46.26 
 
 
227 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  44 
 
 
223 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  43.81 
 
 
257 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
252 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  43.81 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  40.09 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  42.48 
 
 
240 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  40.71 
 
 
241 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  40.71 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  38.72 
 
 
250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  38.26 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  41.74 
 
 
255 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  38.43 
 
 
240 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  37.83 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
243 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  38.96 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  39.82 
 
 
240 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  35.78 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
248 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  39.09 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  38.94 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  37.55 
 
 
252 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
241 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  37.29 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  37.55 
 
 
232 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  37.55 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
252 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  36.99 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
244 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.85 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  26.85 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  30.87 
 
 
324 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  32.46 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  32.42 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  30.32 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  32.05 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  28.63 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  30.87 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  26.96 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  32.48 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  31.84 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  31.84 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  29.69 
 
 
320 aa  71.6  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  29.86 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  29.73 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  31 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  25.65 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  27.95 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  31.51 
 
 
412 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  25.65 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  30 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  29.37 
 
 
247 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  25.65 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  28.64 
 
 
310 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  26.61 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  37.89 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6775  Nucleotidyl transferase  37.8 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  28.64 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  26.75 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  38.83 
 
 
581 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.05 
 
 
842 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  25.55 
 
 
347 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  27.75 
 
 
359 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  29.51 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  28.18 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5466  Nucleotidyl transferase  26.89 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  24.17 
 
 
392 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
399 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  28.19 
 
 
391 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  26.91 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>