More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2844 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  53.1 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  53.1 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  50.46 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  52.23 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  44.05 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  46.85 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  40.54 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  38.7 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  38.6 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 250 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  36.24 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  35.44 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  35.98 
 
 		 239 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  35.93 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  37.23 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  36.17 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  36.09 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  35.65 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  39.06 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  35.75 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  34.21 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  35.44 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  32.88 
 
 		 319 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  33.92 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  31.8 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  30.97 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  27.6 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6775  Nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  31.56 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  31 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  29.61 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  27.11 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  26.73 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  25.56 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  29.18 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.48 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  29.31 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  26.48 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  29.96 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  29.96 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  41.51 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  30.26 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  28.84 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  26.46 
 
 		 364 aa  65.1  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  40.57 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  27.23 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3692  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  22.5 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  29.26 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  27.23 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  27.71 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  26.58 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  22.08 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  30.13 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  41.12 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3833  Nucleotidyl transferase  28.82 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.863849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  29.78 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.99 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.99 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.99 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>