More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0056 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  89.54 
 
 		 241 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  79.17 
 
 		 257 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  79.58 
 
 		 240 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  79.58 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  78.15 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  77.33 
 
 		 240 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  60.42 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  60.58 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  58.82 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  60.68 
 
 		 255 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  56.78 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  57.02 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  56.6 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  54.04 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  56.39 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  53.33 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  53.07 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  52.32 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  52.36 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  49.36 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  50.87 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  50 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  48.68 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  47.58 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  48.31 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  47.81 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  45.34 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  44.3 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  49.56 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  46.84 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  44.55 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  44.3 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  39.29 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  39.04 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  38.3 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.06 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  39.82 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.06 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.55 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  38.43 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  36.55 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  38.43 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  36.25 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.86 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  32.91 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  32.91 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  36.91 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  36.91 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  35.5 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  36.36 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  35.24 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  33.79 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  31.44 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  35.93 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  35.5 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  35.5 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  34.48 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 222 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.44 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  32.63 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  36.24 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  33.92 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  34.21 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  36.4 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  32.9 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  34.91 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 319 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  33.18 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  36.4 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  34.53 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  35.56 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  32.64 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 		 320 aa  95.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  32.76 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 391 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>