More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0084 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  54.47 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  52.16 
 
 
248 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  47.84 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  47.64 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  47.64 
 
 
248 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  47.21 
 
 
248 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  46.35 
 
 
250 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  47.41 
 
 
245 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  47.03 
 
 
250 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  48.29 
 
 
255 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  45.54 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  45.3 
 
 
252 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  46.46 
 
 
241 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
239 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 
236 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  43.29 
 
 
240 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  45.45 
 
 
240 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  45.37 
 
 
241 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  46.29 
 
 
240 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  44.49 
 
 
240 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  44.4 
 
 
239 aa  187  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  44.35 
 
 
232 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  44.73 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 
243 aa  177  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  45.38 
 
 
252 aa  177  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  40.59 
 
 
243 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  42.06 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  41 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  45.61 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  41.85 
 
 
243 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  41.74 
 
 
223 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  41.56 
 
 
221 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  40.87 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  40.59 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  40.61 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.81 
 
 
226 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  36.73 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 
223 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 
223 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
248 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  37.13 
 
 
222 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  36.24 
 
 
223 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  36.32 
 
 
223 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.78 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  29.78 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  32.65 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  32.5 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  32.1 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  32.13 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  32.22 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  34.05 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  29.6 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  30.58 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  30.04 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  35.23 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  30.87 
 
 
223 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  31.51 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  29.29 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  32 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  32.27 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  30.9 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  29.83 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3818  nucleotidyl transferase  32.78 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0106191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0531  nucleotidyl transferase  30.92 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  30.74 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  31.65 
 
 
240 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  32.27 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  27.42 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  29.83 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  30.25 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  29.49 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  39.5 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>