More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1297 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  100 
 
 		 252 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  49.58 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  48.73 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  47.03 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  48.54 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  48.31 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  46.84 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  48.77 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  46.61 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  45.76 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  44.63 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  45.37 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  45.57 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  45.34 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  44.07 
 
 		 248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  47.83 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  42.8 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  41.77 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  41.2 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  42.92 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  41.7 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  42.74 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  39.26 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  40.52 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  38.43 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  39.75 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  37.76 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  39.32 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  37.24 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  42.02 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  37.55 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  39.48 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  40.89 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  38.08 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  36.97 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  35.54 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.17 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  32.29 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  36.09 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  31.84 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  34.71 
 
 		 230 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 223 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  31.12 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  32.22 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  30.94 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  33.89 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  34.32 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  34.02 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  31.38 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.62 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  27.62 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  32.8 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  34.43 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  32.8 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  32.17 
 
 		 230 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  27.9 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  31.51 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  29.8 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  31 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  32.49 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  26.96 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  32.61 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  31.76 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  31.76 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  28.94 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  28.94 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  32.2 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  39.84 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>