More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1524 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  97.29 
 
 		 221 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  84.55 
 
 		 221 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  52.73 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  53.1 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  52.42 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  45.53 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  48.88 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  45.41 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  45.89 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  44.25 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  44.16 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  43.28 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  44.78 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  41.2 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  38.4 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  41.3 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  38.82 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  40.17 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  40.87 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  38.82 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  40.68 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  41.53 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  41.03 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  38.27 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  41.05 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  37.39 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  38.56 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  38.3 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  37.67 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  37.93 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  38.33 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  41.44 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  37.45 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  42.6 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  38.14 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  41.26 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  41.07 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  36.99 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  38.07 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.2 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  35.32 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  36.49 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  36.49 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  40.45 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  36.44 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  36.49 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.34 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  29.52 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  36 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  34.39 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  34.39 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  36.61 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  35.87 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  32.58 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  31.74 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  32.23 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.31 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  34.63 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  37.27 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  35.27 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  34.2 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  34.2 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  34.2 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  34.2 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  34.2 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  34.63 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  33.77 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  31.11 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  33.62 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  29.73 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  29.73 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  34.56 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  34.21 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  36.67 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>