More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1669 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  100 
 
 		 240 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  82.14 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  82.63 
 
 		 214 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  77.93 
 
 		 214 aa  344  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  77 
 
 		 214 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  76.53 
 
 		 214 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  69.38 
 
 		 222 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  62.84 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  62.9 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  68.14 
 
 		 214 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  67.16 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  61.67 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  66.35 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  66.67 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  66.19 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  61.5 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  66.19 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  63.33 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.17 
 
 		 268 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  63.73 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  58.12 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  59.07 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  61.9 
 
 		 260 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.25 
 
 		 237 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.08 
 
 		 212 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  59.17 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  62.86 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  60.49 
 
 		 213 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  59.01 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  60.78 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  60.29 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  59.31 
 
 		 213 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  58.8 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.8 
 
 		 210 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  59.8 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  59.7 
 
 		 212 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  59.8 
 
 		 214 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  58.29 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  61.39 
 
 		 230 aa  255  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  59.41 
 
 		 210 aa  255  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.42 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  57.43 
 
 		 213 aa  254  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  58.17 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  58.21 
 
 		 211 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  57.71 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  56.76 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  58.21 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  58.21 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  59 
 
 		 213 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  58.1 
 
 		 228 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  59 
 
 		 213 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  59 
 
 		 213 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  60.87 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  58.21 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  58.1 
 
 		 228 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.73 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  58.54 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  57.07 
 
 		 213 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  58.05 
 
 		 212 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  57.84 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.97 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.82 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  57.49 
 
 		 212 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  59.2 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  57 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.27 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  57.21 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  57.71 
 
 		 213 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  58 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  55.77 
 
 		 216 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  59.51 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  57.28 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  56.72 
 
 		 211 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  58.05 
 
 		 212 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  58.33 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  57.71 
 
 		 213 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  57.28 
 
 		 214 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  56.86 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.17 
 
 		 211 aa  248  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  58.54 
 
 		 215 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  57.14 
 
 		 211 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  57.21 
 
 		 213 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.33 
 
 		 214 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  57.21 
 
 		 213 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  57.21 
 
 		 213 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  58.05 
 
 		 213 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>