More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07370 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  100 
 
 
308 aa  617  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.83 
 
 
277 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  47.2 
 
 
260 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  56.85 
 
 
256 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.96 
 
 
268 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  43.92 
 
 
257 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.48 
 
 
242 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.84 
 
 
250 aa  205  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.58 
 
 
255 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.74 
 
 
198 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  45.24 
 
 
257 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  42.8 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.64 
 
 
210 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  48.72 
 
 
219 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.49 
 
 
213 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  52.91 
 
 
206 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  44.71 
 
 
257 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  44.09 
 
 
260 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  44.71 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  52.72 
 
 
248 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  45.49 
 
 
257 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  48.24 
 
 
230 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.41 
 
 
248 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  41.73 
 
 
253 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  44.31 
 
 
257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  44.31 
 
 
257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.26 
 
 
240 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  44.31 
 
 
257 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  43.92 
 
 
257 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  51.79 
 
 
217 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  52.97 
 
 
208 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.37 
 
 
201 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.82 
 
 
208 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.82 
 
 
201 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  43.92 
 
 
257 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.22 
 
 
199 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  49.74 
 
 
214 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  47.8 
 
 
249 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  48.98 
 
 
218 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  49.73 
 
 
202 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  48.21 
 
 
217 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  48.21 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.11 
 
 
254 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.69 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.69 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  51.1 
 
 
207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  49.21 
 
 
216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.72 
 
 
210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50.28 
 
 
235 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  43.14 
 
 
259 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  48.74 
 
 
230 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  48.08 
 
 
217 aa  181  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.1 
 
 
217 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.72 
 
 
198 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.03 
 
 
204 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  48.9 
 
 
208 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50 
 
 
207 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.19 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.19 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.19 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  47.69 
 
 
213 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  42.11 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.72 
 
 
209 aa  179  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  51.91 
 
 
199 aa  178  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.72 
 
 
209 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  51.63 
 
 
213 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50 
 
 
207 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  50.83 
 
 
203 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50 
 
 
207 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50.27 
 
 
207 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.12 
 
 
240 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.66 
 
 
197 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  40 
 
 
255 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  50 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  48.72 
 
 
209 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  46.38 
 
 
211 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  48.91 
 
 
226 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.87 
 
 
211 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  49.17 
 
 
198 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  45.89 
 
 
211 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  49.2 
 
 
218 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  52.46 
 
 
214 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.87 
 
 
207 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.63 
 
 
198 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  49.17 
 
 
207 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.45 
 
 
218 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.09 
 
 
198 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.09 
 
 
198 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.34 
 
 
212 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.09 
 
 
198 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.81 
 
 
214 aa  175  9e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  38.13 
 
 
338 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  47.15 
 
 
208 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  45.67 
 
 
211 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>