69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03980 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 390 aa  800    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  36.1 
 
 		 283 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  35.75 
 
 		 291 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  34.36 
 
 		 263 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  32 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  30.08 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  34.16 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  106  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  31.78 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  26.71 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  30.3 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  29.54 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  28.81 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  27.19 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  37.14 
 
 		 287 aa  99.8  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  30.26 
 
 		 282 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  31.74 
 
 		 316 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  25.86 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  28.92 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  26 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  25 
 
 		 409 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  26.19 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  26.36 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  24.51 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  26.89 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  30.19 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  28.1 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  28.85 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  26.53 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  24.68 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  24.66 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  26.2 
 
 		 300 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  25.48 
 
 		 324 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  23.58 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  21.61 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  23.88 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  31.51 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  26.9 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  22.79 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  23.3 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  27.11 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  34.31 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  20.69 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  22.6 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  25 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  28.44 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  36.56 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  26.67 
 
 		 200 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  32.26 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0765  hypothetical protein  36 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000236872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  29.13 
 
 		 188 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.12 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1113  hypothetical protein  29.36 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000453885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  33.87 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  27.16 
 
 		 255 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3163  hypothetical protein  36.97 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  37.25 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5442  putative transmembrane anti-sigma factor  40.38 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  21.49 
 
 		 221 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  22.86 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11370  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>