39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5352 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  34.12 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  33.51 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  33.55 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  27.5 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  26.19 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  25.57 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  28.05 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  29.78 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  31.02 
 
 
335 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  29.23 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  27.11 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  24.62 
 
 
278 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  25.93 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  27.72 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  24.26 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  26.82 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  27.67 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  29.13 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  25.57 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  28.7 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  24 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  28.24 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  26.7 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  27.12 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  33.33 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  22.73 
 
 
294 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  25.73 
 
 
316 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  18.95 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  23.81 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  25.41 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  23.74 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  22.54 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  25.62 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  26.8 
 
 
389 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  24.05 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  27.2 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  27.69 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>