47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0971 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  48.42 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  36.14 
 
 
287 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  35.34 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  34.54 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  36.15 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  32.89 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  34.59 
 
 
489 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  30.26 
 
 
390 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  26.99 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  25.1 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  22.3 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  25.32 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  25.24 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  23.29 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  24.4 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  25.29 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  23.08 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  25.93 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  23.57 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  28.33 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  23.47 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  24.18 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  24.88 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  22.27 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  24.34 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  20.76 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  26.67 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  23.7 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  24.34 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  22.64 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  22.47 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  29.31 
 
 
355 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  22.62 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  22.81 
 
 
409 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  23.21 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  24.26 
 
 
338 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  24.12 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  25.27 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  22.02 
 
 
312 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2621  hypothetical protein  21.71 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629908  normal  0.423953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  24.38 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  24.66 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0399  hypothetical protein  23.17 
 
 
280 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.383519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  19.87 
 
 
298 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  22.32 
 
 
329 aa  45.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>