14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2136 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0399  hypothetical protein  30.29 
 
 
280 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.383519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2621  hypothetical protein  28.66 
 
 
298 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629908  normal  0.423953 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  24.19 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  25.84 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  24.34 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  21.55 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  25.15 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  25.38 
 
 
295 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  23.2 
 
 
291 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  21.15 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  21.4 
 
 
287 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  22.86 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  19.83 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>