43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5450 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  36.56 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  31.46 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  29.43 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  31.46 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  35.82 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  31.1 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  27.42 
 
 		 283 aa  96.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  31.74 
 
 		 390 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  28.05 
 
 		 439 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  27.35 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  31.93 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  29.94 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  26.82 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  28.65 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  27.18 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  26.02 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  23.81 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  24.5 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  25.22 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  24.42 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  30.2 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  23.77 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  31.45 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  24.64 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  25.25 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  24.78 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  25.6 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  24.4 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  24.59 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  27.04 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  26.94 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  24.2 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  21.17 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  25 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  22.75 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  26.17 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  23.03 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  18.84 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>