48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03115 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  525  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  48.42 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  35.18 
 
 
287 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  40.93 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  37.44 
 
 
291 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  40 
 
 
286 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  31.11 
 
 
316 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  33.48 
 
 
390 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  28.38 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  30.52 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  30.19 
 
 
489 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  25.11 
 
 
409 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  22.73 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  24.64 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  25.27 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  23.23 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  23.93 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  24.19 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  24.44 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  26.18 
 
 
439 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  27.4 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  24.26 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  24.42 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  23.86 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  21.4 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  20.2 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  24.24 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  25.71 
 
 
365 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  22.47 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  25.64 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  21.29 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  21.92 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  30.96 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  25.38 
 
 
389 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  26.42 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  19.51 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  23.62 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  23.47 
 
 
351 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  27.17 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  22.87 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  21.91 
 
 
320 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  22.64 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  20.26 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  19.25 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  19.61 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  22.4 
 
 
310 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>