41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2126 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  27.81 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  33.16 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  30.04 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  28.96 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  25.78 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  25.75 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  26.42 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  30.65 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  27.13 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  25.95 
 
 
283 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  24.56 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  26.11 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  39.47 
 
 
489 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  29.75 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  22.62 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  22.27 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  26.9 
 
 
287 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  27.78 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  32.98 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  29.78 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  25.87 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  39.53 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  32.26 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  23.38 
 
 
439 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  22.64 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  26.28 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  25.93 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  33.33 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  21.9 
 
 
316 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  24.03 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  19.7 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  26.75 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  27.61 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  26.32 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  23.39 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>