45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2837 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  901    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  28.15 
 
 
283 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  29.25 
 
 
333 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  30.37 
 
 
314 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  25.99 
 
 
287 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  28.99 
 
 
316 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  29.22 
 
 
321 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  36.17 
 
 
489 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  23.85 
 
 
305 aa  91.3  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  27.11 
 
 
390 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  31.08 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  24.39 
 
 
286 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  28.64 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  25.82 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  23.7 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  26.4 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  27.76 
 
 
300 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  25.73 
 
 
295 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  24.9 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  26.88 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  23.95 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  25.12 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  26.94 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  26.06 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  28.87 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  25.93 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  27.75 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  26.63 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  29.76 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  25.24 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  32.14 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  26.57 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  24.22 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  25.91 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  25.27 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  28.94 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  25.37 
 
 
306 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  25.47 
 
 
324 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  25.68 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  22.4 
 
 
318 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>