48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3419 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  100 
 
 		 327 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  41.95 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  37.42 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  37.62 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  43.5 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  45.59 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  45.07 
 
 		 389 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  36.52 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  44.09 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  29.17 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  35.09 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  37.67 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  27.63 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  37.54 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  29.94 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  33.94 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  34.81 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  30.17 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  26.74 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  31.78 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  29.15 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  23.08 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  30.88 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  33.56 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  26.11 
 
 		 439 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  25.7 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  32.84 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  31.88 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  23.37 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  27.54 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  25.26 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  31.58 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  23.14 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  35.26 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  21.98 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  23.01 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  32.73 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  24.22 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  28.83 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  24.37 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  29.29 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  21.82 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  28.65 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  24.73 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  30.67 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  30.67 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>