49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1299 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  931    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  34.38 
 
 
282 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  42.76 
 
 
335 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  35.76 
 
 
287 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  37.31 
 
 
286 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  36.17 
 
 
439 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  36.13 
 
 
320 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  37.76 
 
 
306 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  34.38 
 
 
291 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  35.29 
 
 
291 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  28.65 
 
 
263 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  25.09 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  31.93 
 
 
316 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  43.75 
 
 
283 aa  87.4  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  32.14 
 
 
336 aa  86.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  35.03 
 
 
290 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  33.77 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  25.57 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  34.65 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  34.42 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  35.19 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  31.11 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  31.28 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  31.86 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  28.65 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  35.26 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  28.95 
 
 
295 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  32 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  31.65 
 
 
316 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  33.55 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  32.28 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  36.3 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  40 
 
 
327 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  26.32 
 
 
300 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  32.92 
 
 
345 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  26.57 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  24.74 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  32.52 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  35.98 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  29.66 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  29.52 
 
 
324 aa  67  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  31.88 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  28.4 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  25.41 
 
 
365 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  28.87 
 
 
245 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  31.76 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  31.62 
 
 
299 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  28.35 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>