46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7463 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  100 
 
 
351 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  35.79 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  30.4 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  31.51 
 
 
345 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  37.6 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  35.18 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  32.6 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  34.1 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  36.02 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  34.15 
 
 
312 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  37.38 
 
 
327 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  30.57 
 
 
333 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  28.27 
 
 
305 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  30.09 
 
 
306 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  31.43 
 
 
336 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  31.21 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  26.07 
 
 
283 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  29.07 
 
 
329 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  29.57 
 
 
300 aa  85.9  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  26.81 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  26.85 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  24.59 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  34.65 
 
 
489 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  25.09 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  26.89 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  24.51 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  32.32 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  26.98 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  26.76 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  26.69 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  20.67 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  26.61 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  28.88 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  21.74 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  21.62 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  29.05 
 
 
355 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  27.19 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  27.4 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  21.01 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  24.84 
 
 
318 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  23.47 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  18.62 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  23.64 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  24.36 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  23.81 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  21 
 
 
327 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>