48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1043 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  47.12 
 
 
354 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  45.19 
 
 
336 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  40.5 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  39.05 
 
 
316 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  37.61 
 
 
312 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  38.25 
 
 
318 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  35.79 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  33.64 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  33.69 
 
 
333 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  33.02 
 
 
324 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  39.6 
 
 
327 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  37.06 
 
 
389 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  32.57 
 
 
351 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  23.92 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  34.96 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  28.09 
 
 
409 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  26.5 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  26.26 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  31.29 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  32.86 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  27.03 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  32.69 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  31.1 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  30.3 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  23.64 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  31.11 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  29.38 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  28.76 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  21.92 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  31.39 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  25.24 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  25.68 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  29.82 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  24.58 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  32.73 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  25.79 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  24.41 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  30.42 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  30.1 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  26.09 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  19.64 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  31.13 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  32.67 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  20.44 
 
 
294 aa  52.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  24.32 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  31.22 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>