15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1440 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  98.99 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  85.61 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  29.91 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1239  putative secreted protein  28.71 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615287  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  25.79 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19030  hypothetical protein  30.23 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.201714  normal  0.225368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  29.29 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  26.26 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  19.87 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1643  hypothetical protein  28.82 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  28.35 
 
 		 489 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  30.15 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  27.36 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  26.28 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>