32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2291 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  27.92 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  27.92 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  25.39 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  28.21 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  30.34 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  28.18 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  25.94 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  27.98 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  23.62 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  21.03 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  26.63 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  25.6 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  23.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1239  putative secreted protein  26.4 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615287  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  20.4 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  32.54 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  24.51 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  27.22 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  26.74 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  26.44 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  24.19 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  30.48 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  21.54 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  21.8 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  29.14 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  24.22 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  23.31 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>