48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  33.44 
 
 
409 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  36.07 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  36.92 
 
 
354 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  39.91 
 
 
336 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  29.87 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  39.43 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  32.75 
 
 
345 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  32.03 
 
 
333 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  34.57 
 
 
318 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  31.48 
 
 
306 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  30.17 
 
 
312 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  31.37 
 
 
316 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  31.27 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  36.76 
 
 
327 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  30.69 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  30.96 
 
 
351 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  30.98 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  30.3 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  28.19 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  25.41 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  27.41 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  26.91 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  26.84 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  22.87 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  30.91 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  24.1 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  24.09 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  23.95 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  23.02 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  26.81 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  25.73 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  28.36 
 
 
355 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  22.17 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  26.6 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  23.53 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  25.99 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  27.69 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  28.7 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  27.99 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  20.49 
 
 
282 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  24.88 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  25.12 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  20.5 
 
 
294 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  27.59 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  24.04 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  27.22 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  27.48 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>