52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3106 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  31.23 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  29.37 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  29.46 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  29.44 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  29.29 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  29.62 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  26.16 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  34.12 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  25.23 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  29.51 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  27.57 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  30.25 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  23.08 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  27.9 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  27.22 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  22 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  26.94 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  30.64 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  31.05 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  27.99 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  22.38 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  32.85 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  30.57 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  23.79 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  32.7 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  32.73 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  24.89 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  23.01 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  30.98 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  27.72 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  31.84 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  31.32 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  26.64 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  30.68 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  25.23 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  29.47 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  27.19 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  25.79 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  27.04 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  26.85 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  30 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  26.61 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  26.32 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2136  hypothetical protein  20 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1440  hypothetical protein  30.15 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.356685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1715  hypothetical protein  30.15 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  decreased coverage  0.00427271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  30.22 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>