46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1898 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  100 
 
 		 333 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  46.13 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  33.7 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  39.39 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  44.33 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  48.26 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  37.67 
 
 		 354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  38.37 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  29.3 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  32.71 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  37.09 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  32.99 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  26.98 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4543  hypothetical protein  28.23 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  27.52 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  31.9 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  26.01 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  33.51 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  31.64 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  33.77 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5450  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  24.78 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  26.24 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  23.24 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  24.78 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  28.18 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  25.94 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  27.03 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  23.67 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  23.58 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  25.57 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  27.05 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  26.42 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  21.56 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  26.51 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  22.17 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  22.62 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  24.7 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2291  hypothetical protein  32.54 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851516  decreased coverage  0.000683391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>