82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1304 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  48.34 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  46.94 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  45.79 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  46.46 
 
 		 313 aa  262  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  44.9 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  44.56 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  43.88 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  43.54 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  44.33 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  42.86 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  42.66 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  41.33 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  37.42 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  33.44 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  34.17 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  31.58 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  28.09 
 
 		 1182 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  28.51 
 
 		 1182 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.22 
 
 		 791 aa  59.7  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  25.31 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.03 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.03 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.28 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 		 801 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.97 
 
 		 807 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  28.18 
 
 		 1188 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.97 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  27.93 
 
 		 1188 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.72 
 
 		 615 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  28.16 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  27.08 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  27.67 
 
 		 1188 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  25.69 
 
 		 819 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  22.76 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.4 
 
 		 605 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.7 
 
 		 839 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  26.09 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  25.2 
 
 		 781 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  27.35 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  26.34 
 
 		 1187 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  26.5 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  24.65 
 
 		 1191 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  26.24 
 
 		 774 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  25.79 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  29.07 
 
 		 1227 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  27.31 
 
 		 780 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.15 
 
 		 609 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.29 
 
 		 610 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  25.58 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  26.32 
 
 		 1176 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  24.51 
 
 		 793 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  28.74 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  28.09 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  27.1 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  28.74 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.81 
 
 		 612 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  28.21 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  28.46 
 
 		 1228 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  25.62 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.63 
 
 		 804 aa  45.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  28.99 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  30.57 
 
 		 1259 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  27.82 
 
 		 1249 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.84 
 
 		 616 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.24 
 
 		 605 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1643  B12-dependent methionine synthase  30.43 
 
 		 1262 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0494405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  26.39 
 
 		 768 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  25.29 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  26.39 
 
 		 768 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  30.22 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  30.09 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.24 
 
 		 637 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.69 
 
 		 610 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  27.23 
 
 		 1178 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  24.37 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.51 
 
 		 605 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.78 
 
 		 800 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  27.43 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  26.42 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>