More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3534 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
162 aa  326  8e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  73.46 
 
 
162 aa  246  9e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  73.46 
 
 
161 aa  238  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  71.34 
 
 
164 aa  238  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  74.07 
 
 
161 aa  222  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  62.18 
 
 
162 aa  197  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
162 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 
162 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
163 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
159 aa  135  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 
164 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
162 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
178 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 
163 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
160 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
160 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
164 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
163 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  32.48 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
168 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
163 aa  111  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
160 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
160 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 
161 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
160 aa  100  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  26.43 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  24.64 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  25.9 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  24.64 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  30.41 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  24.62 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  29.73 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  27.4 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  24.64 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  26.57 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  23.91 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  23.91 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  24.64 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.97 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>