179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2219 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  46.69 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  37.05 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  40.29 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  31.3 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.96 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  31.39 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  101  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  28.7 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  28.25 
 
 		 300 aa  98.6  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  28.03 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  30.41 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.38 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  29.53 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  32.72 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.76 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.07 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  27.39 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  31.65 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  31.51 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  30.73 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  30.73 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  30.28 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  26.24 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  25.3 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  31.63 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  27.38 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.75 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  23.86 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  27.35 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  29.68 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  25.81 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  29.68 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  29.03 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  29.03 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  26.92 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  24.89 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  26.15 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  27.94 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  28.64 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.74 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  25.89 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.74 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.74 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.74 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  25.45 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  33.63 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  35.09 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  30.63 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  28.19 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  25.45 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  28.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  28.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.65 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  28.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27.6 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  28.08 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  34.82 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  37.93 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  23.68 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  35.29 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  25.35 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>