More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3081 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
171 aa  356  9e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.3 
 
 
174 aa  208  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.28 
 
 
172 aa  204  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  56.98 
 
 
174 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  53.33 
 
 
236 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  51.49 
 
 
192 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  46.38 
 
 
245 aa  131  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.48 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  44.85 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  46.38 
 
 
252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  47.1 
 
 
253 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.45 
 
 
248 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  45.65 
 
 
245 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  48.06 
 
 
229 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  45.45 
 
 
250 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  48.48 
 
 
235 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.39 
 
 
161 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.58 
 
 
161 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.41 
 
 
164 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  43.8 
 
 
275 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  48 
 
 
225 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  49.61 
 
 
236 aa  121  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
215 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  47.2 
 
 
240 aa  120  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  47.2 
 
 
231 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  47.2 
 
 
231 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.65 
 
 
215 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  47.2 
 
 
231 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.85 
 
 
219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.11 
 
 
209 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.62 
 
 
309 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.85 
 
 
219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  42.47 
 
 
225 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  43.94 
 
 
229 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.82 
 
 
283 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.12 
 
 
219 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.78 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  48.03 
 
 
226 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.96 
 
 
215 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.21 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.62 
 
 
227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.09 
 
 
163 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.75 
 
 
169 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.54 
 
 
246 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
165 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  40.67 
 
 
239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.6 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  40.56 
 
 
162 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.51 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  41.67 
 
 
252 aa  111  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.76 
 
 
179 aa  111  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  41.61 
 
 
200 aa  111  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.94 
 
 
205 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  39.63 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.38 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.18 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.65 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.78 
 
 
213 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.1 
 
 
196 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  42.54 
 
 
201 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  38.82 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
175 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
175 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
200 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.41 
 
 
196 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.41 
 
 
196 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  42.42 
 
 
200 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.54 
 
 
182 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
200 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  39.26 
 
 
199 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
200 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
200 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  37.58 
 
 
204 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  38.22 
 
 
206 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
202 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  37.75 
 
 
202 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  37.95 
 
 
200 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  42.42 
 
 
200 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  38.22 
 
 
204 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  37.95 
 
 
200 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  47.2 
 
 
253 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  36.59 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  42.75 
 
 
200 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  37.2 
 
 
200 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.43 
 
 
199 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  43.94 
 
 
214 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  40.15 
 
 
200 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.82 
 
 
179 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
162 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  44.35 
 
 
175 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0140  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.23 
 
 
266 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  35.98 
 
 
200 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  36.31 
 
 
204 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>