More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1380 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  100 
 
 
175 aa  363  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  55.69 
 
 
173 aa  191  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4080  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.59 
 
 
170 aa  187  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  51.2 
 
 
166 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.99 
 
 
166 aa  167  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1244  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  44.91 
 
 
173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.79 
 
 
161 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.14 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.65 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  38.31 
 
 
162 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.95 
 
 
215 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  38.75 
 
 
229 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.61 
 
 
248 aa  111  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  39.24 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.14 
 
 
215 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  39.86 
 
 
225 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.86 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.67 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.29 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.86 
 
 
219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  39.04 
 
 
213 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.29 
 
 
219 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  39.87 
 
 
202 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  39.87 
 
 
202 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  42.22 
 
 
200 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  42.22 
 
 
200 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.25 
 
 
230 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  39.04 
 
 
240 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.86 
 
 
215 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  41.61 
 
 
201 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  44.44 
 
 
250 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.91 
 
 
172 aa  104  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.68 
 
 
236 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  40.8 
 
 
252 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.37 
 
 
309 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.35 
 
 
171 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.67 
 
 
174 aa  101  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  41.73 
 
 
192 aa  101  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.39 
 
 
209 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  41.5 
 
 
200 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  42.28 
 
 
225 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  36.67 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.41 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.05 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  38.41 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.81 
 
 
246 aa  99  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.03 
 
 
205 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  37.42 
 
 
231 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  42.74 
 
 
236 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  38.01 
 
 
205 aa  98.2  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  37.42 
 
 
231 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  37.42 
 
 
231 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.33 
 
 
309 aa  97.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.67 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
235 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.5 
 
 
283 aa  97.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.19 
 
 
204 aa  97.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  35.06 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  38.41 
 
 
245 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  37.42 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  34.88 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  38.69 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  38.69 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.37 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  37.96 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  33.12 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.56 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.37 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1663  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.6 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.86 
 
 
787 aa  95.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  35.98 
 
 
229 aa  94.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  39.31 
 
 
200 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.23 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.06 
 
 
212 aa  94  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  36.2 
 
 
201 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  35.53 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  37.12 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  38.69 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  34.67 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0183  NADH dehydrogenase subunit C  37.31 
 
 
262 aa  93.2  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  38.41 
 
 
245 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  36.55 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  39.01 
 
 
236 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  35.53 
 
 
206 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.77 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  37.23 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.12 
 
 
245 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  36.57 
 
 
213 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  39.37 
 
 
253 aa  92.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  37.24 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.82 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>