More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7017 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
173 aa  357  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  55.69 
 
 
175 aa  191  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  52.73 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1244  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  52.38 
 
 
173 aa  181  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.27 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4080  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.81 
 
 
170 aa  171  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  39.46 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  39.24 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.93 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  44.25 
 
 
250 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.93 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  36.05 
 
 
229 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.36 
 
 
248 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.31 
 
 
162 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  34.69 
 
 
225 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  37.34 
 
 
202 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  36.84 
 
 
226 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  37.34 
 
 
202 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  35.67 
 
 
214 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  40 
 
 
213 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.37 
 
 
162 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.48 
 
 
283 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.03 
 
 
215 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.05 
 
 
164 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  37.66 
 
 
236 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  39.04 
 
 
200 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.39 
 
 
219 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.39 
 
 
219 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.14 
 
 
190 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.29 
 
 
236 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  40.3 
 
 
284 aa  99.4  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.62 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
196 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.49 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.03 
 
 
215 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.16 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.12 
 
 
219 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.25 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.5 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.17 
 
 
205 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.1 
 
 
230 aa  97.4  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  42.34 
 
 
240 aa  97.4  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.31 
 
 
309 aa  97.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.13 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  36.17 
 
 
205 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  37.14 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  37.14 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  35.77 
 
 
225 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.73 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.97 
 
 
246 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.95 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  34.78 
 
 
245 aa  95.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.13 
 
 
204 aa  95.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  35.51 
 
 
192 aa  94.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.1 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  32.52 
 
 
201 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  34.03 
 
 
229 aa  94  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  35.51 
 
 
245 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  32.87 
 
 
252 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.48 
 
 
245 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
253 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0628  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.72 
 
 
576 aa  92.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  34.35 
 
 
275 aa  92.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.65 
 
 
227 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.86 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  34.32 
 
 
201 aa  91.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  34.42 
 
 
213 aa  91.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  32.59 
 
 
235 aa  91.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.55 
 
 
212 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.73 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  35.42 
 
 
236 aa  90.9  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.73 
 
 
202 aa  90.9  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  36.31 
 
 
200 aa  90.9  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1663  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.96 
 
 
186 aa  90.9  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  31.36 
 
 
200 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  38.05 
 
 
239 aa  90.9  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  34.69 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  32.89 
 
 
200 aa  90.9  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.84 
 
 
593 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  37.84 
 
 
231 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  34.91 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  32.93 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  32.91 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.77 
 
 
203 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  38.58 
 
 
206 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  37.84 
 
 
231 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  31.85 
 
 
252 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  37.84 
 
 
231 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  37.88 
 
 
281 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.39 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  32.89 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1288  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 
227 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.57 
 
 
787 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  30.82 
 
 
200 aa  89  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  40.71 
 
 
253 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  33.77 
 
 
199 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  35 
 
 
204 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  32.32 
 
 
199 aa  87.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2834  NADH dehydrogenase I chain C  30.16 
 
 
227 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>