More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1244 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1244  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  100 
 
 
173 aa  361  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.38 
 
 
173 aa  181  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  50 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.8 
 
 
166 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4080  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.97 
 
 
170 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  44.91 
 
 
175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  33.11 
 
 
240 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  41.13 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  34.87 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  35.76 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.46 
 
 
209 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.14 
 
 
174 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.77 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.14 
 
 
174 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.36 
 
 
215 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  35.03 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.03 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34 
 
 
190 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  32.24 
 
 
231 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  32.24 
 
 
231 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  32.24 
 
 
231 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  35.37 
 
 
200 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.76 
 
 
215 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  36.99 
 
 
200 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  37.8 
 
 
250 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  40.98 
 
 
214 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  35.37 
 
 
200 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.93 
 
 
219 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  34.19 
 
 
162 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  36.3 
 
 
202 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.32 
 
 
215 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.56 
 
 
219 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  35.53 
 
 
205 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  37.9 
 
 
200 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.56 
 
 
219 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  38.71 
 
 
200 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  34.25 
 
 
205 aa  100  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.21 
 
 
197 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.19 
 
 
162 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.19 
 
 
164 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.84 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  32.91 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
248 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.84 
 
 
161 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
236 aa  99  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.81 
 
 
205 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  31.29 
 
 
229 aa  98.2  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  38.21 
 
 
200 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  38.21 
 
 
200 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
215 aa  97.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  39.52 
 
 
202 aa  97.4  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  39.52 
 
 
202 aa  97.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.71 
 
 
204 aa  97.4  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.5 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  31.32 
 
 
227 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  31.32 
 
 
227 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.88 
 
 
227 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  31.97 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  36.59 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  31.65 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.16 
 
 
794 aa  95.5  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.31 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  28.38 
 
 
309 aa  94  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  32.28 
 
 
201 aa  94.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 
202 aa  94.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.19 
 
 
196 aa  94  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.34 
 
 
580 aa  94  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  29.34 
 
 
172 aa  94  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  33.11 
 
 
200 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.19 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  34.18 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  37.19 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  30.47 
 
 
213 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  33.11 
 
 
787 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.65 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.87 
 
 
283 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  32.19 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  30.67 
 
 
225 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  31.21 
 
 
284 aa  92  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.72 
 
 
794 aa  92  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  36.3 
 
 
208 aa  92  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  32.03 
 
 
236 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  35.1 
 
 
199 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1663  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.06 
 
 
186 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1405  NADH dehydrogenase (quinone)  32.9 
 
 
203 aa  91.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  32.45 
 
 
200 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.38 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0988  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.35 
 
 
239 aa  91.3  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  34.44 
 
 
199 aa  90.9  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.98 
 
 
192 aa  90.9  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.282798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  30.82 
 
 
200 aa  90.9  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  31.13 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  28.67 
 
 
229 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.61 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.42 
 
 
593 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  32.91 
 
 
200 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.61 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.02 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  37.3 
 
 
281 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  33.59 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>