31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1626 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
506 aa  1028    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  57.17 
 
 
694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  31.36 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.79 
 
 
701 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 
591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.3 
 
 
558 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.08 
 
 
584 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.51 
 
 
532 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.01 
 
 
469 aa  110  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  28.13 
 
 
815 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 
728 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  27.25 
 
 
583 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 
417 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 
590 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.65 
 
 
506 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.36 
 
 
506 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  27.27 
 
 
342 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.89 
 
 
857 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  35.36 
 
 
315 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  34.62 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  26.13 
 
 
313 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.59 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.66 
 
 
385 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
341 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.67 
 
 
711 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.06 
 
 
364 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  36.36 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.43 
 
 
383 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>