112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0048 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  691  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  60.6 
 
 
305 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 
323 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 
320 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  36.67 
 
 
305 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  37.89 
 
 
298 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  36.6 
 
 
284 aa  197  2e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 
296 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  40.13 
 
 
309 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  37.83 
 
 
308 aa  188  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  38.33 
 
 
304 aa  184  2e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  37.09 
 
 
275 aa  184  2e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
285 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 
285 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  34.42 
 
 
301 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
309 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  37.2 
 
 
603 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  34.87 
 
 
282 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  34.19 
 
 
278 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
301 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 
302 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  35.56 
 
 
279 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 
276 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  34.21 
 
 
276 aa  154  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
308 aa  154  3e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 
349 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.75 
 
 
301 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  37.72 
 
 
607 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 
313 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
276 aa  148  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
289 aa  147  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 
280 aa  146  4e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
284 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  30.74 
 
 
276 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  33.79 
 
 
279 aa  141  1e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 
283 aa  141  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  32.67 
 
 
295 aa  142  1e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
295 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
322 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
287 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  31.71 
 
 
320 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  28.81 
 
 
301 aa  132  1e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  30.46 
 
 
294 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  30.03 
 
 
299 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  29.75 
 
 
280 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.79 
 
 
323 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.84 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
270 aa  77.8  2e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.03 
 
 
291 aa  65.5  1e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.01 
 
 
308 aa  58.9  1e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  28.05 
 
 
312 aa  57.4  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  28.05 
 
 
312 aa  57.4  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  28.05 
 
 
312 aa  57.4  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  28.05 
 
 
312 aa  57.4  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  36.72 
 
 
319 aa  55.8  9e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  27.64 
 
 
312 aa  55.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  34.62 
 
 
319 aa  54.7  2e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.61 
 
 
314 aa  53.5  4e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.06 
 
 
305 aa  52.8  8e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.99 
 
 
243 aa  52.8  9e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  32.79 
 
 
314 aa  52.8  9e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52.4  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52  1e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52.4  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.84 
 
 
327 aa  52.4  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.38 
 
 
307 aa  52.4  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  32.09 
 
 
393 aa  52  2e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 
251 aa  51.2  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  23.13 
 
 
307 aa  52  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  23.21 
 
 
307 aa  51.2  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  24.78 
 
 
323 aa  50.4  4e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  22.74 
 
 
299 aa  49.7  8e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  24.55 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  22.42 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  22.15 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  22.42 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  25.95 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  25.23 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  32.73 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  32.73 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  25.18 
 
 
381 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.69 
 
 
312 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  23.55 
 
 
308 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.39422e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  24.91 
 
 
291 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.6 
 
 
318 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.82 
 
 
250 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  22.93 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  23.64 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.85 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  23.45 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  25.37 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  32.82 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  31.01 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>