More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1366 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  56.95 
 
 
302 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 
322 aa  319  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
306 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  46.2 
 
 
322 aa  300  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 
311 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  44.04 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
303 aa  261  8e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  43.56 
 
 
305 aa  255  8e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 
304 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 
304 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
304 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 
304 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 
311 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
305 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
304 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 
304 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  40.66 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  40.66 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  41.47 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  40.66 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  40.66 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 
307 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 
306 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  41.31 
 
 
307 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
309 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
308 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  41.97 
 
 
307 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
307 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.8 
 
 
308 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  41.12 
 
 
312 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
308 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 
308 aa  229  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 
312 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  40.59 
 
 
304 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 
304 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
308 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
309 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
309 aa  228  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 
317 aa  228  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  41.41 
 
 
304 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
306 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  41.41 
 
 
304 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
308 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
308 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
304 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  42.86 
 
 
307 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  43.19 
 
 
307 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
308 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
309 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
308 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  43.05 
 
 
307 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
316 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
308 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
308 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  39.02 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 
306 aa  225  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
309 aa  225  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41 
 
 
304 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 
307 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 
319 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 
307 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
309 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
311 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 
303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
304 aa  222  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 
306 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>