233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1571 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  416  1e-115  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  52.79 
 
 
204 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  54.31 
 
 
204 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  51.53 
 
 
203 aa  201  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  51.53 
 
 
203 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  51.53 
 
 
203 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  54.31 
 
 
204 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  54.31 
 
 
204 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  54.31 
 
 
204 aa  191  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  54.31 
 
 
204 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  51.26 
 
 
203 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  48.47 
 
 
204 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  47.96 
 
 
204 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  53.81 
 
 
205 aa  189  3e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  53.81 
 
 
205 aa  189  3e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  53.81 
 
 
205 aa  188  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  53.81 
 
 
205 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  53.81 
 
 
205 aa  188  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  52.79 
 
 
204 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  52.79 
 
 
204 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  52.79 
 
 
204 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  45.69 
 
 
206 aa  185  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  49.48 
 
 
207 aa  184  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  52.28 
 
 
204 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  50.75 
 
 
203 aa  182  2e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  51.78 
 
 
204 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  47.45 
 
 
204 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  48.99 
 
 
207 aa  178  5e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  65.93 
 
 
207 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  44.33 
 
 
211 aa  172  4e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  43.08 
 
 
204 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  45.13 
 
 
204 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  43.08 
 
 
204 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  42.21 
 
 
242 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  42.78 
 
 
204 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  44.62 
 
 
204 aa  164  7e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  43.59 
 
 
204 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  44.67 
 
 
204 aa  163  2e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  43.59 
 
 
204 aa  163  2e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  42.35 
 
 
204 aa  163  2e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  50.75 
 
 
210 aa  162  2e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  48.21 
 
 
209 aa  162  4e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  41.54 
 
 
204 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  43.59 
 
 
204 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  47.06 
 
 
176 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  41.03 
 
 
208 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  46.43 
 
 
208 aa  154  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  44.13 
 
 
205 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  40.72 
 
 
204 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  37.76 
 
 
219 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.89 
 
 
205 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  39.34 
 
 
274 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.27 
 
 
211 aa  140  1e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  38.42 
 
 
206 aa  138  4e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  138  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  48 
 
 
198 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.16 
 
 
198 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  46.15 
 
 
198 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 
207 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  48.8 
 
 
201 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  36.73 
 
 
208 aa  121  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.79 
 
 
211 aa  119  4e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  34.55 
 
 
225 aa  119  4e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  35.26 
 
 
209 aa  117  1e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  34.5 
 
 
214 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  36.84 
 
 
211 aa  114  8e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  35.68 
 
 
211 aa  113  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  114  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  35.91 
 
 
213 aa  113  2e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  36.07 
 
 
204 aa  112  4e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  34 
 
 
211 aa  112  4e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  38.14 
 
 
204 aa  110  1e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  35.15 
 
 
211 aa  110  1e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.13 
 
 
212 aa  110  2e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  34.38 
 
 
197 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.66 
 
 
221 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.75512e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  33.5 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  2.66179e-13 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  34.04 
 
 
193 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  32.29 
 
 
194 aa  108  4e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  34.97 
 
 
209 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  44.6 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 
239 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  34.63 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  34.63 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.63 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48336e-11 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  34.04 
 
 
197 aa  108  7e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  35.79 
 
 
211 aa  108  7e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  35.79 
 
 
211 aa  108  7e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.63 
 
 
211 aa  107  9e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.85 
 
 
209 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0592  protein of unknown function UPF0029  36 
 
 
210 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.655997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.7 
 
 
213 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  38.35 
 
 
201 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
192 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.53627e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  34.05 
 
 
190 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  45.8 
 
 
213 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  46.09 
 
 
245 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  32.81 
 
 
194 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  51.28 
 
 
199 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>