More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0423 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  100 
 
 		 2042 aa  4161    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  34.66 
 
 		 1809 aa  821    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  34 
 
 		 1570 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  31.53 
 
 		 1570 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.76 
 
 		 1776 aa  358  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  30.77 
 
 		 1962 aa  339  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  33.08 
 
 		 1618 aa  265  6e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  33.7 
 
 		 1570 aa  259  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  26.26 
 
 		 1233 aa  213  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0676  proteinase, putative  29.89 
 
 		 885 aa  209  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 		 891 aa  170  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.29 
 
 		 883 aa  155  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  29.51 
 
 		 1407 aa  151  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  29.51 
 
 		 1407 aa  151  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1407 aa  145  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  28.19 
 
 		 1406 aa  144  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.44 
 
 		 915 aa  143  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.69 
 
 		 660 aa  141  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  25.91 
 
 		 917 aa  139  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  26.44 
 
 		 917 aa  139  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 		 860 aa  138  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  27.96 
 
 		 917 aa  133  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  28.49 
 
 		 917 aa  131  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.64 
 
 		 917 aa  132  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 		 1124 aa  130  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  25.5 
 
 		 917 aa  130  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  24.81 
 
 		 917 aa  129  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  27.11 
 
 		 1300 aa  128  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  25.28 
 
 		 917 aa  128  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  25.28 
 
 		 917 aa  128  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.25 
 
 		 860 aa  127  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.5 
 
 		 1565 aa  127  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 		 728 aa  126  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.87 
 
 		 1293 aa  123  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  27.27 
 
 		 1042 aa  116  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  26.75 
 
 		 1298 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  27.08 
 
 		 1298 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  24.71 
 
 		 1300 aa  112  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  26.92 
 
 		 1298 aa  111  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  26.43 
 
 		 1298 aa  110  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 		 1649 aa  106  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  27.08 
 
 		 1220 aa  105  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.72 
 
 		 1212 aa  105  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  24.51 
 
 		 1739 aa  103  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  25.43 
 
 		 983 aa  100  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.15 
 
 		 1474 aa  98.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 		 1323 aa  97.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.89 
 
 		 1215 aa  97.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  24.11 
 
 		 1705 aa  95.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  24.11 
 
 		 1705 aa  95.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.88 
 
 		 1705 aa  92.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1639 aa  89.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  30.48 
 
 		 485 aa  89  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.98 
 
 		 1212 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  24.96 
 
 		 1321 aa  87.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 		 1092 aa  85.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.22 
 
 		 500 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.98 
 
 		 1212 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.98 
 
 		 1212 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  24.74 
 
 		 1287 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  23.02 
 
 		 1725 aa  84  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.87 
 
 		 1888 aa  81.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.26 
 
 		 1669 aa  82  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.73 
 
 		 370 aa  81.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.32 
 
 		 1706 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.77 
 
 		 605 aa  80.9  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  22.67 
 
 		 1634 aa  79.7  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  25.58 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.54 
 
 		 1399 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  26.78 
 
 		 526 aa  79  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.38 
 
 		 1649 aa  77.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 		 1215 aa  77  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.36 
 
 		 1659 aa  77  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  24.01 
 
 		 994 aa  77  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 		 639 aa  77  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  22.62 
 
 		 1116 aa  76.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  26.1 
 
 		 514 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  29.61 
 
 		 801 aa  75.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 495 aa  75.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.34 
 
 		 1283 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  28.9 
 
 		 1035 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.88 
 
 		 1110 aa  74.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 		 1000 aa  74.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  24.24 
 
 		 1312 aa  73.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.03 
 
 		 401 aa  73.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  23.45 
 
 		 1115 aa  73.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.19 
 
 		 1261 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.16 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.14 
 
 		 397 aa  73.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  23.08 
 
 		 1683 aa  72.8  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 		 966 aa  71.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.02 
 
 		 1075 aa  72  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  27.68 
 
 		 408 aa  72  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.5 
 
 		 1099 aa  72  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.9 
 
 		 1286 aa  72  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  21.44 
 
 		 1638 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.99 
 
 		 490 aa  71.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  28.17 
 
 		 399 aa  70.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2247  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.88 
 
 		 536 aa  71.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 		 520 aa  70.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>